Do przeprowadzenia operacji wyznaczono 11 dywizji strzeleckich oraz wojska pancerne i jednostki pomocnicze wchodzące w skład 50. Armii 3. Frontu Białoruskiego lub czasowo jej podporządkowane. Wiosną 1945 r. zdobywały one rejon Królewca i tam operowały do końca wojny. Zanim „Stawka” wycofała je do Związku Sowieckiego i podjęto decyzję o ich demobilizacji, wykonały jeszcze – niejako po drodze – rozkaz likwidacji polskiego i litewskiego podziemia, którego żołnierze działali w okolicach Puszczy Augustowskiej.

Sztab dowództwa 50. Armii ulokował się w Suwałkach, sztaby korpusów zaś miały siedziby w Suwałkach, Sejnach, Augustowie i Dąbrowie Białostockiej. Szacuje się, że do przeprowadzenia tej operacji Sowieci zaangażowali ok. 50 000 żołnierzy. Dysponowali artylerią, jednostkami saperskimi i inżynieryjnymi. Mogli też liczyć na wsparcie lotnictwa.

Plan przeprowadzenia operacji został przedstawiony w rozkazie bojowym sztabu 50. Armii z 11 lipca 1945 r. Podległym jednostkom, które zajęły już w tym dniu pozycje wyjściowe, wyznaczono linie, do których miały dotrzeć w określonym czasie. Żołnierzy ustawiono w dwóch szeregach i nakazano tyralierą przemieszczać się w wyznaczonym kierunku. Ujętych partyzantów kierowano do znajdujących się na tyłach funkcjonariuszy „Smierszu”, a saperom kazano zniszczyć schrony i kryjówki. Na tyłach w pogotowiu bojowym miały się przemieszczać pododdziały wyposażone w artylerię i ciężkie karabiny maszynowe.

Zasadnicza część operacji miała miejsce między 12 a 18 lipca. W kolejnych dniach wycofano z niej dwie dywizje, które skierowano w okolice Grodna. Obszar obławy opuścił również 2. Gwardyjski Korpus Pancerny, a sztab 50. Armii przeniósł się do Olecka. Pozostałe na miejscu trzy korpusy strzeleckie powtórzyły przeszukiwanie terenu Puszczy Augustowskiej. W chwili zmiany dowództwa 50. Armii, która nastąpiła 25 lipca, działania były już wyraźnie wygaszane. Stopniowo wycofywano kolejne oddziały, chociaż dopiero w połowie września 1945 r. teren operacji opuściły ostatnie jednostki. Były to stacjonujące w Suwałkach pododdziały 81. Korpusu Strzeleckiego.